Fundado em 1863 na Alemanha, o Grupo Bayer consolidou-se como uma das mais importantes e respeitadas indústrias internacionais, oferecendo ao mercado uma ampla gama de produtos e serviços, que abrange os campos da saúde, agricultura e materiais inovadores.
No Brasil, sua história é conhecida por mais de 114 anos de tradição. Tudo começou em 1896, quando dois consultores técnicos da Bayer desembarcaram no Rio de Janeiro com a missão de levantar as possibilidades comerciais da jovem República. Nesse mesmo ano foi fundada a primeira representante dos produtos Bayer no Brasil, a Walty Lindt & Cia.
A primeira firma de representação comercial própria da Bayer foi fundada em fevereiro de 1911. A Frederico Bayer & Cia., com sede no Rio de Janeiro, passou a responder por toda a distribuição dos produtos no país.
Devido ao grande sucesso dos produtos, em 1921 foi fundada a Chimica Industrial Bayer Weskott & Cia, que, além de importar e comercializar os produtos da Bayer alemã, iniciou a produção local de medicamentos, alavancada por Aspirina® e CafiAspirina®.
O crescimento da Empresa sempre foi constante, tornando-se uma das mais expressivas indústrias alemãs no Brasil.
Desde a década de 30, as campanhas publicitárias da Bayer tornaram-se peças fundamentais e arrojadas, contribuindo de forma decisiva para o sucesso no mercado brasileiro. Notável publicitário e poeta, Bastos Tigre criou em 1922 um dos slogans mais conhecidos da propaganda brasileira: "Se é Bayer, é bom", mensagem que atravessou gerações de brasileiros e é usada até os dias de hoje no Brasil e em países de língua espanhol: "Si es Bayer, es bueno".
Somente após a 2ª Guerra, a Bayer voltou a investir no Brasil. Assim, em 1956, adquiriu uma antiga fábrica de ácidos, instalada em um terreno no distrito de Belford Roxo - Baixada Fluminense (RJ). A unidade foi inaugurada em junho de 1958, dando origem ao moderno Parque Industrial da Bayer de hoje, ocupando 1,9 milhão de m2. Nesse mesmo ano, a Bayer chegou ao bairro do Socorro, na cidade de São Paulo, para onde transferiu sua sede administrativa em 1973.
Em 1992, depois de várias mudanças, o nome da Empresa passou para Bayer S.A.
Na cidade de São Paulo, em 1999, foi inaugurada uma nova fábrica de produtos farmacêuticos, com investimentos na ordem de US$ 25 milhões, que trouxeram para o Brasil modernas tecnologias e equipamentos, atendendo exigências internacionais de "Boas Práticas de Produção" (GMP) e com capacidade para abastecer todo o Mercosul.
Em 2002, o Grupo Bayer deu início à maior reestruturação mundial de sua história. Foi criada uma holding estratégica que controlava quatro empresas comerciais: Bayer HealthCare, Bayer CropScience, Bayer Chemicals e Bayer Polymers. No Brasil, a Companhia passou a ser formada por apenas três empresas comerciais: Bayer S.A., Bayer CropScience Ltda e Bayer Seeds Ltda.
No mesmo ano, os negócios de inseticidas domésticos (p.ex. Baygon), repelentes (p.ex. Autan), produtos de limpeza e purificadores de ar foram vendidos à SC Johnson e a subsidiária Haarmann & Reimer passou para o controle do grupo sueco EQT Northern Europe Private Equity Funds.
A Bayer AG definiu, em 2003, a criação de uma nova empresa química, a Lanxess, resultado da junção entre os negócios da Bayer Chemicals com cerca de um terço da Bayer Polymers. Com essa mudança, a Bayer Polymers passou a ser conhecida no ano seguinte como Bayer MaterialScience.
Em meados de 2004, a Lanxess começou a funcionar mundialmente como uma companhia independente pertencente ao Grupo Bayer. A Bayer, a BASF e a Hoechst assinaram no mesmo período um acordo de venda da DyStar com a Platinum Equity.
Ainda como parte da estratégia de reestruturação, o Grupo Bayer comprou a área de Consumer Health da Roche em janeiro de 2005, quando também ocorreu o spin-off da Lanxess Ltda.
O ano de 2006 também foi marcado pelo gerenciamento estratégico do portfólio do Grupo. A compra da Schering, por 17 bilhões de euros, foi a maior aquisição da história do Grupo Bayer. Outra mudança importante no segmento de saúde foi a venda da área de Produtos Diagnósticos para a Siemens.
A Bayer MaterialScience também passou por importantes mudanças em 2006. A subsidiária H.C Starck, que produz pós-metálicos e cerâmicos, produtos químicos especiais, componentes cerâmicos para engenharia e metais refratários, foi adquirida pela Advent International e o Carlyle Group. A Wolff Walsrode, que atua no segmento de produtos de celulose, foi vendida para a Dow Química.
Com o objetivo de fortalecer ainda mais sua imagem e presença no Brasil, no início de 2007, o Grupo Bayer concluiu a incorporação da Bayer S.A. pela Bayer CropScience e hoje atua apenas com uma única empresa legal no País: a Bayer S.A..